| 1. | Abrod | 92,0000 | obvod 100 m | Bratislavský kraj - Malacky |
| 2. | Apálsky ostrov | 85,9746 | obvod 100 m | Nitriansky kraj - Komárno |
| 3. | Bábsky les | 30,3900 | obvod 100 m | Nitriansky kraj - Nitra |
| 4. | Bačkovská dolina | 220,0400 | obvod 100 m | Košický kraj - Trebišov |
| 5. | Badínsky prales | 30,0300 | 123,4300 | Banskobystrický kraj - Banská Bystrica |
| 6. | Batizovská dolina | 523,1900 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Poprad |
| 7. | Becherovská tisina | 24,1300 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Bardejov |
| 8. | Belianske lúky | 89,4206 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Kežmarok |
| 9. | Belianske Tatry | 5 407,6500 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Poprad |
| 10. | Bielovodská dolina | 3 712,1400 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Poprad |
| 11. | Bielska skala | 15,0500 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Tvrdošín |
| 12. | Bokšov | 146,7100 | obvod 100 m | Košický kraj - Košice - okolie |
| 13. | Boky | 176,4900 | obvod 100 m | Banskobystrický kraj - Zvolen |
| 14. | Botiansky luh | 40,6300 | obvod 100 m | Košický kraj - Trebišov |
| 15. | Bradlo | 97,6700 | obvod 100 m | Trenčiansky kraj - Bánovce nad Bebravou |
| 16. | Bujanovská dubina | 88,1700 | obvod 100 m | Košický kraj - Košice - okolie |
| 17. | Burdov | 364,1400 | obvod 100 m | Nitriansky kraj - Nové Zámky |
| 18. | Čergovská javorina | 10,7200 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Prešov |
| 19. | Čergovský Minčol | 171,0836 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Bardejov, Sabinov, Stará Ľubovňa |
| 20. | Červené skaly | 390,5000 | obvod 100 m | Košický kraj - Spišská Nová Ves |
| 21. | Červený rybník | 118,9100 | obvod 100 m | Trnavský kraj - Senica |
| 22. | Číčovské mŕtve rameno | 79,8715 | 55,2553 | Nitriansky kraj - Komárno, Trnavský kraj - Dunajská Streda |
| 23. | Demänovská dolina | 836,8800 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Liptovský Mikuláš |
| 24. | Devínska Kobyla | 651,5600 | nemá OP | Bratislavský kraj - Bratislava IV |
| 25. | Dobročský prales | 103,8500 | 100,4400 | Banskobystrický kraj - Brezno |
| 26. | Dolina Bielej vody | 1 661,1100 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Poprad |
| 27. | Dreveník | 101,8186 | obvod 100 m | Košický kraj - Spišská Nová Ves, Prešovský kraj - Levoča |
| 28. | Dubník | 165,1900 | obvod 100 m | Trnavský kraj - Galanta |
| 29. | Ďumbier | 2 043,7600 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Liptovský Mikuláš |
| 30. | Furkotská dolina | 842,4300 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Poprad |
| 31. | Galmuská tisina | 55,9600 | obvod 100 m | Košický kraj - Spišská Nová Ves |
| 32. | Gýmešský jarok | 20,6200 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Prešov |
| 33. | Hajdúchy | 56,1100 | obvod 100 m | Bratislavský kraj - Pezinok |
| 34. | Harmanecká tisina | 20,0400 | obvod 100 m | Banskobystrický kraj - Banská Bystrica |
| 35. | Havešová | 171,3200 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Snina |
| 36. | Hlboča | 123,0700 | obvod 100 m | Trnavský kraj - Trnava |
| 37. | Hnilecká jelšina | 15,2600 | obvod 100 m | Banskobystrický kraj - Brezno, Košický kraj - Rožňava, Prešovský kraj - Poprad |
| 38. | Horný les | 543,0200 | obvod 100 m | Bratislavský kraj - Malacky |
| 39. | Horšianska dolina | 313,3772 | obvod 100 m | Nitriansky kraj - Levice |
| 40. | Hradová hora | 13,4900 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Sabinov |
| 41. | Hranovnická dubina | 66,4900 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Poprad |
| 42. | Hrdovická | 30,0300 | obvod 100 m | Nitriansky kraj - Topoľčany |
| 43. | Hrončecký grúň | 55,3000 | 112,8300 | Banskobystrický kraj - Brezno |
| 44. | Humenec | 86,0800 | obvod 100 m | Košický kraj - Košice - okolie |
| 45. | Humenská | 70,3700 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Humenné |
| 46. | Humenský Sokol | 241,5000 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Humenné |
| 47. | Chleb | 412,8700 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Martin, Žilina |
| 48. | Choč | 1 428,0500 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Dolný Kubín, Ružomberok |
| 49. | Jánska dolina | 1 696,5300 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Liptovský Mikuláš |
| 50. | Jarabá skala | 359,9400 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Snina |
| 51. | Javorníček | 15,0600 | obvod 100 m | Trenčiansky kraj - Nové Mesto nad Váhom |
| 52. | Javorová dolina | 2 250,8900 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Poprad |
| 53. | Jovsianska hrabina | 257,5800 | obvod 100 m | Košický kraj - Michalovce |
| 54. | Juráňova dolina | 434,3200 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Tvrdošín |
| 55. | Kamenná Baba | 127,5900 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Prešov |
| 56. | Kašivárová | 49,8000 | obvod 100 m | Banskobystrický kraj - Žarnovica |
| 57. | Kašvár | 116,4264 | obvod 100 m | Košický kraj - Trebišov |
| 58. | Kľačianska Magura | 204,4700 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Martin |
| 59. | Kľak | 85,7100 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Martin, Žilina |
| 60. | Kláštorské lúky | 85,9915 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Martin |
| 61. | Klátovské rameno | 306,4400 | obvod 100 m | Trnavský kraj - Dunajská Streda |
| 62. | Klenovský Vepor | 257,6437 | 85,3888 | Banskobystrický kraj - Brezno, Rimavská Sobota |
| 63. | Kokošovská dubina | 20,0000 | 23,6300 | Prešovský kraj - Prešov |
| 64. | Komárnická jedlina | 74,7000 | nemá OP | Prešovský kraj - Svidník |
| 65. | Kopčianske slanisko | 9,0477 | obvod 100 m | Košický kraj - Michalovce |
| 66. | Kotlový žľab | 70,7700 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Tvrdošín |
| 67. | Kozol | 91,5800 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Žilina |
| 68. | Kôprová dolina | 3 220,9200 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Poprad |
| 69. | Krivé | 203,7200 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Žilina |
| 70. | Kršlenica | 117,3400 | obvod 100 m | Bratislavský kraj - Malacky |
| 71. | Kvačianska dolina | 461,7900 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Liptovský Mikuláš |
| 72. | Kyjovský prales | 397,4197 | nemá OP | Prešovský kraj - Humenné |
| 73. | Latorický luh | 15,0800 | obvod 100 m | Košický kraj - Trebišov |
| 74. | Leliansky les | 198,7400 | obvod 100 m | Nitriansky kraj - Nové Zámky |
| 75. | Ľubietovský Vepor | 236,8793 | obvod 100 m | Banskobystrický kraj - Banská Bystrica |
| 76. | Lysec | 70,0400 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Martin |
| 77. | Malý Milič | 14,0500 | obvod 100 m | Košický kraj - Košice - okolie |
| 78. | Malý Polom | 86,1000 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Čadca |
| 79. | Manínska tiesňava | 117,6300 | 70,4900 | Trenčiansky kraj - Považská Bystrica |
| 80. | Mäsiarsky bok | 127,8100 | obvod 100 m | Banskobystrický kraj - Krupina |
| 81. | Mengusovská dolina | 1 612,9600 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Poprad |
| 82. | Minčol | 96,1000 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Dolný Kubín, Námestovo |
| 83. | Mláčik | 147,2000 | obvod 100 m | Banskobystrický kraj - Zvolen |
| 84. | Mlynická dolina | 704,2900 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Poprad |
| 85. | Mních | 74,7500 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Liptovský Mikuláš |
| 86. | Mokriny | 882,8200 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Kežmarok, Poprad |
| 87. | Mraznica | 159,8000 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Poprad |
| 88. | Oblík | 90,0000 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Vranov nad Topľou |
| 89. | Ohnište | 852,2600 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Liptovský Mikuláš |
| 90. | Osobitá | 457,9800 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Tvrdošín |
| 91. | Ostrov orliaka morského | 22,7700 | obvod 100 m | Trnavský kraj - Dunajská Streda |
| 92. | Palotská jedlina | 157,1500 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Medzilaborce |
| 93. | Parížske močiare | 184,0464 | obvod 100 m | Nitriansky kraj - Nové Zámky |
| 94. | Patianska cerina | 26,5000 | obvod 100 m | Nitriansky kraj - Levice |
| 95. | Pľaša | 110,8000 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Snina |
| 96. | Plavno | 52,5879 | obvod 100 m | Banskobystrický kraj - Banská Bystrica |
| 97. | Pod Latiborskou hoľou | 161,2342 | nemá OP | Banskobystrický kraj - Brezno |
| 98. | Pod Ruským | 11,1412 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Snina |
| 99. | Podskalský Roháč | 105,5700 | obvod 100 m | Trenčiansky kraj - Považská Bystrica |
| 100. | Pohanská | 128,9300 | obvod 100 m | Bratislavský kraj - Malacky |
| 101. | Pohanský hrad | 223,3500 | obvod 100 m | Banskobystrický kraj - Lučenec, Rimavská Sobota |
| 102. | Ponická dúbrava | 13,3400 | obvod 100 m | Banskobystrický kraj - Banská Bystrica |
| 103. | Pramenisko Tople | 28,6600 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Bardejov |
| 104. | Pramenište | 45,5700 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Poprad |
| 105. | Príboj | 10,9600 | obvod 100 m | Banskobystrický kraj - Banská Bystrica |
| 106. | Prípor | 272,2700 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Žilina |
| 107. | Prosiecka dolina | 341,7300 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Liptovský Mikuláš |
| 108. | Ragáč | 9,7300 | obvod 100 m | Banskobystrický kraj - Rimavská Sobota |
| 109. | Rajtopíky | 119,6700 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Levoča |
| 110. | Regetovské rašelinisko | 2,5519 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Bardejov |
| 111. | Roháčske plesá | 451,6600 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Tvrdošín |
| 112. | Rokoš | 460,4100 | obvod 100 m | Trenčiansky kraj - Bánovce nad Bebravou, Prievidza |
| 113. | Roštún | 333,3100 | obvod 100 m | Bratislavský kraj - Malacky |
| 114. | Rozsutec | 841,5500 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Dolný Kubín, Žilina |
| 115. | Rožok | 67,1300 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Snina |
| 116. | Salatín | 1 192,9900 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Liptovský Mikuláš, Ružomberok |
| 117. | Senianske rybníky | 213,3100 | 211,2800 | Košický kraj - Michalovce, Sobrance |
| 118. | Sitno | 93,6800 | obvod 100 m | Banskobystrický kraj - Banská Štiavnica |
| 119. | Sivá Brada | 19,5472 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Levoča |
| 120. | Sivec | 169,7900 | obvod 100 m | Košický kraj - Košice - okolie |
| 121. | Sivý vrch | 112,6700 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Tvrdošín |
| 122. | Skalka | 2 659,8100 | obvod 100 m | Banskobystrický kraj - Brezno |
| 123. | Skalnatá dolina | 1 069,0500 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Poprad |
| 124. | Slavkovská dolina | 979,0000 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Poprad |
| 125. | Sokolec | 199,2400 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Dolný Kubín |
| 126. | Starý hrad | 85,4200 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Žilina |
| 127. | Stebnícká Magura | 184,2400 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Bardejov |
| 128. | Stinská | 90,7800 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Snina |
| 129. | Strážov | 480,0100 | obvod 100 m | Trenčiansky kraj - Ilava, Považská Bystrica, Žilinský kraj - Žilina |
| 130. | Studené doliny | 2 222,4100 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Poprad |
| 131. | Stužica | 761,4900 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Snina |
| 132. | Suchá dolina | 1 585,5400 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Liptovský Mikuláš |
| 133. | Suchý | 429,4200 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Žilina |
| 134. | Súľovské skaly | 543,2300 | 281,7700 | Žilinský kraj - Bytča |
| 135. | Svrčinník | 222,4900 | obvod 100 m | Banskobystrický kraj - Banská Bystrica, Žilinský kraj - Turčianske Teplice |
| 136. | Šarišský hradný vrch | 145,7400 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Prešov |
| 137. | Šimonka | 33,5200 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Prešov, Vranov nad Topľou |
| 138. | Šíp | 301,5200 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Dolný Kubín, Ružomberok |
| 139. | Šomoška | 36,6200 | obvod 100 m | Banskobystrický kraj - Lučenec |
| 140. | Šrámková | 243,6500 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Dolný Kubín |
| 141. | Štôlska dolina | 739,9600 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Poprad |
| 142. | Šúr | 654,9590 | 144,7297 | Bratislavský kraj - Pezinok, Senec |
| 143. | Šútovská dolina | 526,6500 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Dolný Kubín, Martin |
| 144. | Tajba | 27,3600 | obvod 100 m | Košický kraj - Trebišov |
| 145. | Tematínska lesostep | 59,6700 | 7,6000 | Trenčiansky kraj - Nové Mesto nad Váhom |
| 146. | Tiesňavy | 479,2100 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Žilina |
| 147. | Tichá dolina | 5 966,6400 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Poprad, Žilinský kraj - Liptovský Mikuláš |
| 148. | Turiec | 89,2899 | 543,3089 | Žilinský kraj - Martin, Turčianske Teplice |
| 149. | Turková | 107,0000 | 30,9500 | Žilinský kraj - Liptovský Mikuláš |
| 150. | Uhlištiatka | 385,5100 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Poprad |
| 151. | Vápeč | 75,3800 | obvod 100 m | Trenčiansky kraj - Ilava |
| 152. | Važecká dolina | 1 185,8600 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Poprad |
| 153. | Včelár | 8,7600 | obvod 100 m | Nitriansky kraj - Zlaté Moravce |
| 154. | Velická dolina | 1 217,2200 | obvod 100 m | Prešovský kraj - Poprad |
| 155. | Veľká Bránica | 332,0900 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Žilina |
| 156. | Veľká Rača | 313,0000 | 197,0000 | Žilinský kraj - Čadca |
| 157. | Veľká skala | 59,2000 | obvod 100 m | Trenčiansky kraj - Prievidza |
| 158. | Veľký Javorník | 13,9500 | obvod 100 m | Žilinský kraj - Čadca |
| 159. | Veľký Milič | 67,8100 | obvod 100 m | Košický kraj - Košice - okolie |
| 160. | Vozárska | 76,6300 | obvod 100 m | Košický kraj - Košice - okolie |
| 161. | Vtáčnik | 245,6200 | obvod 100 m | Banskobystrický kraj - Žarnovica, Trenčiansky kraj - Prievidza |
| 162. | Vyšehrad | 48,6500 | obvod 100 m | Trenčiansky kraj - Prievidza, Žilinský kraj - Turčianske Teplice |
| 163. | Zadná Poľana | 855,4941 | obvod 100 m | Banskobystrický kraj - Brezno, Detva, Zvolen |
| 164. | Záruby | 299,9900 | obvod 100 m | Trnavský kraj - Trnava |
| 165. | Zelienka | 141,6800 | obvod 100 m | Trnavský kraj - Senica |
| 166. | Zoborská lesostep | 23,0800 | obvod 100 m | Nitriansky kraj - Nitra |